Tiga puluh tahun yang lalu sebuah fenomena aneh yang disebut "spacequake" menghancurkan pusat Eurasia, merenggut nyawa setidaknya 150 juta orang. Sejak itu, spacequake yang lebih kecil mengganggu dunia secara tidak teratur. Shido Itsuka, seorang siswa sekolah menengah yang tampaknya biasa menemukan seorang gadis misterius di ground zero dari spacequake dan mengetahui bahwa dia adalah salah satu "Roh" yang merupakan penyebab sebenarnya dari spacequake yang terjadi ketika mereka menampakkan diri di dunia. Dia direkrut untuk memanfaatkan kemampuan misteriusnya untuk menyegel kekuatan Roh sehingga menghentikan mereka dari ancaman bagi umat manusia. Namun, ada masalah: untuk menyegel kekuatan Roh, dia harus membuatnya jatuh cinta padanya dan menciumnya.
